1、酶活性變化

雞糞堆積發酵過程中的一切生物化學過程都是在酶的參與下進行的，酶活性大小反映了有機物料堆制中各種生物化學過程的強度。接種微生物菌劑的雞糞堆肥，由于菌劑中含有較多產纖維素酶、蛋白酶、脂肪酶和過氧化氫酶等酶的微生物。因此，其各種酶活性顯著高于自然堆制。

2、增加肥效

微生物可以分解雞糞中的淀粉、脂類化合物、半纖維素和蛋白質等較易分解的物質以及部分纖維素和少量木質素，其中部分轉化為水溶性碳、氮化合物，同時初期被微生物利用的部分碳、氮源隨著微生物的死亡而被逐漸分解釋放。因此，可以增加糞便中水溶性碳、氮的含量。與雞糞自然發酵相比，由于微生物菌劑產生的各種酶類能催化有機質快速轉化為腐殖態，接種微生物菌劑的堆肥在相同時間里能合成較多腐殖態碳、氮。另一方面，微生物菌劑能產生一些酸性物質，降低雞糞的PH值，減少雞糞發酵過程中氨的揮發，保持較多氮素，提高肥效，保護環境。

3、提高對作物的安全性

尿酸、NH4+-N是雞糞中主要影響作物正常生長的物質，微生物菌劑能促進堆肥中的氮物質向蛋白氮和NH3+-N轉化，減少NH4+-N的累積，能快速消除或減少致使作物生長障礙的物質。

4、可制作成其他動物的粗飼料

雞糞干物質中粗蛋白占31%～33%，其中有一半以上是尿酸、尿素、肌酸、氨等非蛋白氮以及雞糞本身含有的粗纖維和墊草中的大量粗纖維。所以雞糞是養殖畜、禽、魚的好飼料，但生雞糞中含有寄生蟲卵及一些有毒物質和病菌，不能用生雞糞直接進行飼喂，必須在雞糞中添加微生物菌劑進行高溫發酵處理，才能成為無毒且營養豐富的飼料。